prof. Ing. Štefan Janeček, DrSc.
Prof. Ing. Štefan Janeček, DrSc. je profesorom Oddelenia biológie Ústavu biológie a biotechnológie FPV UCM v Trnave a vedúcim skupiny Laboratórium evolúcie proteínov (http://imb.savba.sk/~janecek/). Oblasť jeho výskumu predstavujú enzýmy a proteíny z alfa-amylázových rodín klasifikovaných v databáze CAZy (http://www.cazy.org/) v rodinách GH13, GH57, GH119 a GH126. Hlavný dôraz vedeckej práce spočíva v in silico prístupoch k štúdiu ich unikátnych sekvenčno-štruktúrnych čŕt v spojení s ich špecificitou (substrátová preferencia a produktový profil), ako aj ich evolúcie. Pozornosť je venovaná aj škrob-viažucim doménam týchto enzýmov, klasifikovaných ako CBM rodiny. Vo všeobecnosti je to oblasť bioinformatiky proteínov so zameraním sa na in silico štúdium proteínov a ich možný proteínový dizajn. Prof. Janeček vo svojej pedagogickej práci vyučuje predmety Molekulárno-biologické databázy a Bioinformatika na bakalárskom stupni a Pokročilá bioinformatika a Proteínový dizajn na magisterskom stupni. Tiež pravidelne vedie diplomantov a školí študentov doktorandského štúdia. Prof. Janeček je zakladateľom a hlavným organizátorom medzinárodných konferencií o amylolytických enzýmoch – ALAMY (http://imb.savba.sk/~janecek/Alamys/), ktoré sa konajú od roku 2001 v trojročných intervaloch tradične na Smolenickom zámku na Slovensku. Pôsobí aj ako manažérsky redaktor časopisu Biologia (SpringerNature), sekcia Cellular and Molecular Biology (https://link.springer.com/journal/11756).
Dôležité odkazy
- Janeček Š.* (1994) Sequence similarities and evolutionary relationships of microbial, plant and animal α-amylases. European Journal of Biochemistry 224: 519-524.
- Janeček Š.*, Svensson B. & Henrissat B. (1997) Domain evolution in the α-amylase family. Journal of Molecular Evolution 45: 322-331.
- Oslancová A. & Janeček Š.* (2002) Oligo-1,6-glucosidase and neopullulanase enzyme subfamilies from the alpha-amylase family defined by the fifth conserved sequence region. Cellular and Molecular Life Sciences 59: 1945-1959.
- Blesák K. & Janeček Š.* (2012) Sequence fingerprints of enzyme specificities from the glycoside hydrolase family GH57. Extremophiles 16: 497-506.
- Janeček Š.*, Svensson B. & MacGregor E.A. (2014) α-Amylase – an enzyme specificity found in various families of glycoside hydrolases. Cellular and Molecular Life Sciences 71: 1149-1170.
- Mareček, F., Janeček, Š.: A Novel Subfamily GH13_46 of the α-Amylase Family GH13 Represented by the Cyclomaltodextrinase from Flavobacterium sp. No. 92. Molecules, 2022, 27 (24), 8735.
- Mareček, F., Terrapon, N., Janeček, Š: Two newly established and mutually related subfamilies GH13_48 and GH13_49 of the alfa-amylase family GH13. Applied Microbiology and Biotechnology, 2024, 108, 1, 415.
- Janeček, Š., Brumer, H., Henrissat, B. (2023). News, trends, and challenges in Carbohydrate-Active enZymes. Biologia, 2023, 78(7), pp. 1739–1740
- Janeček, Š. (2023). Advances in Amylases—What’s Going on? Molecules, 2023, 28(21), 7268
- Janíčková Z. & Janeček Š.* (2020) Fungal α-amylases from three GH13 subfamilies: their sequence-structural features and evolutionary relationships. International Journal of Biological Macromolecules 159: 763-772.
- Janeček Š.: Eur. J. Biochem. 1994, 224: 519-524. - Da Lage JL, Renard E, Chartois F, Lemeunier F, CariouML: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE USA 1998, 95, 6848-6853.
- Janeček Š., Svensson B. & Henrissat B.: J. Mol. Evol. 1997, 45: 322-331. - Syson K, Stevenson CEM, Rejzek M, Fairhurst SA, Nair A, Bruton CJ, Field RA, Chater KF, Lawson DM, Bornemann S: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 2011, 286, 38298-38310.
- Oslancová A. & Janeček Š.: Cell. Mol. Life Sci. 2002, 59: 1945-1959. - Moller MS, Fredslund F, Majumder A, Nakai H, Poulsen JCN, Lo Leggio L, Svensson B, Abou Hachem M: JOURNAL OF BACTERIOLOGY 2012, 194, 4249-4259.
- Blesák K. & Janeček Š.: Extremophiles 2012, 16: 497-506. - Suzuki E; Suzuki R: CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES 2016, 73, 2643-2660.
- Janeček, Š., Svensson B. & MacGregor E.A.: Cell. Mol. Life Sci. 2014, 71: 1149-1170. - Cerqueira FM; Photenhauer AL; Pollet RM; Brown HA; Koropatkin NM: TRENDS IN MICROBIOLOGY 2020, 28, 95-108.
VEGA – 2/0146/17 – 2017-2020: „Evolúcia amylolytických enzýmov.“ Zodpovedný riešiteľ.
VEGA – 2/0146/21 – 2020-2024: „Amylolytické enzýmy – tisíce sekvencií, stovky štruktúr, desiatky špecificít – a čo evolúcia...?“ Zodpovedný riešiteľ
| Aktivita, funkcia | Názov inštitúcie, grémia | Časové vymedzenia pôsobenia |
|---|---|---|
| Osoba zodpovedná za ŠP Aplikovaná biológia (Bc.) | FPV UCM v Trnave | 2019-doteraz |
| Osoba zodpovedná za OHIK Molekulárna biológia | FPV UCM v Trnave | 2019-doteraz |
| Garant doktorandského štúdia v študijnom odbore Chémia (Biochémia) na UMB SAV | Ústav molekulárnej biológie SAV v Bratislave | 2019-doteraz |
| Predseda Stálej komisie pre obhajoby doktorských dizertačných prác v odbore Molekulárna biológia | SKVH | 2021-doteraz |
| Managing Editor časopisu „Biologia“, section Cellular and Molecular Biology | Springer | 1995-doteraz |
| Associate Editor časopisu „3Biotech“ | Springer | 2017-doteraz |
| Zakladateľ a Editor-in-Chief časopisu „Amylase“ | DeGruyter | 2017-doteraz |
| Vysoká škola alebo inštitúcia | Rok | Odbor a program |
|---|---|---|
| Chemickotechnologická fakulta SVŠT v Bratislave | 1987 | Kvasná chémia a bioinžinierstvo |
| Chemickotechnologická fakulta SVŠT v Bratislave | 1989 | Kvasná chémia a bioinžinierstvo |
| Chemickotechnologická fakulta STU v Bratislave | 1993 | Kvasná chémia a technológia |
| Prírodovedecká fakulta UK v Bratislave | 2015 | Molekulárna biológia |
| Univerzita sv. Cyrila a Metoda v Trnave | 2021 | Molekulárna biológia |
| Vedecká rada UK v Bratislave | 2002 | Molekulárna biológia |
| Pracovné zaradenie | Inštitúcia | Obdobie |
|---|---|---|
| Interný ašpirant | Katedra biochemickej technológie, Fakulta chemickej a potravinárskej technológie, STU v Bratislave | 1989-1992 |
| Odborný pracovník, vedecký pracovník, samostatný vedecký pracovník, vedúci vedecký pracovník | Ústav ekobiológie SAV, Ústav mikrobiológie SAV, Ústav molekulárnej biológie SAV v Bratislave | 1993-doteraz |
| Pedagogický pracovník, docent, profesor, garant/spolugarant | Katedra biotechnológií, Katedra biológie, Fakulta prírodných vied UCM v Trnave | 2001-doteraz |
| Názov predmetu | Študijný program | Stupeň | Študijný odbor |
|---|---|---|---|
| Molekulárno-biologické databázy | Aplikovaná biológia | I. | 3. Biológia |
| Bioinformatika | Aplikovaná biológia | I. | 3. Biológia |
| Pokročilá bioinformatika | Aplikovaná biológia | II. | 3. Biológia |
| Proteínový dizajn | Aplikovaná biológia | II. | 3. Biológia |
| Fukčná analýza proteínov a modelovanie | Molekulárna biológia | III. | 3. Biológia |
| Študijný program | Stupeň | Študijný odbor |
|---|---|---|
| Aplikovaná biológia | I. | 3. Biológia |
| Bakalárske | Diplomové | Dizertačné | |
|---|---|---|---|
| Počet aktuálne vedených prác | 0 | 1 | 2 |
| Počet obhájených prác | 10 | 19 | 7 |
| Celkovo | Za posledných šesť rokov | |
|---|---|---|
| Počet výstupov tvorivej činnosti | 107 | 18 |
| Výstupy registrované vo Web of Science alebo Scopus | 97 | 16 |
| Ohlasy registrované vo Web of Science alebo Scopus | 3000 | 1200 |
| Počet prednášok na medzinárodnej a národnej úrovni | 18 | 11 |
| Odbor habilitačného a inauguračného konania | Priradený študijný odbor |
|---|---|
| Molekulárna biológia | 3. Biológia |
Námestie J. Herdu 577/2, 917 01 Trnava